总体来讲流产和胚胎停育的原因可分为以下几种：

主要是染色体的问题，染色体异常会导致胚胎不发育而致早期流产，染色体异常包括数量和结构异常，数量上的异常可分为非整倍体和多倍体，最常见的异常核型为三倍体，其他有单倍体，四倍体因卵裂异常致胚胎不发育。结构异常有缺失，平衡易位、倒置、重叠等。平衡易位是最常见的染色体异常。有时候即便是夫妻染色体检查均正常，胚胎也会有染色体变异。一般染色体变异的卵子受精以后，不能发育成胚胎，但也有部分患者生化或者胎停/流产。

一、母体因素

1. 子宫方面

子宫内膜太薄、先天或后天的子宫异常，比如子宫纵膈、子宫肌瘤、宫腔粘连等，都存在导致不着床和胎停育的风险。不过大部分的子宫异常问题，都可以通过B超等妇科检查及时发现，在怀孕前治疗和改善 。

2. 内分泌

黄体功能不足: 胚胎着床及继续发育依赖于复杂的内分泌系统彼此协调。作为母体来讲，自身的内源性激素不足，就满足不了胚胎的需要，就有可能造成胚胎的停育和流产。黄体体功能不全可造成子宫内膜发育迟缓和黄体期短，从而影响受精卵的种植，或早期妊娠流产。黄体功能不全者常伴有其他腺体功能异常，如甲状腺功能亢进或减退、糖尿病、雄激素相对增多症及高泌乳素血症等，这些因素均不利于胚胎发育，与流产密切相关。

二、免疫因素

母胎间的免疫不适应而引起母体对胎儿的排斥。常见的自身免疫疾病为系统性红斑狼疮、硬皮病、混合性结缔组织病、皮肌炎等。还有就是生殖免疫的问题，如果我们自身带某种抗体，就有可能影响胚胎的发育。

三、不良环境的影响

如有毒化学物质、放射线、高温等也可引起胚胎染色体异常。建议选择做试管的家庭，尽量不要住新装修的房子，或暂时不要买新家具、新车等产品，以免接触不良因素，导致不孕或流产。

目前国内一代二代试管对于胚胎分级也只是停留在胚胎外观上，即便是级别很高的8细胞胚胎，可能也会存在出现多次反复的着床失败、胎停、流产。如果出现2次以上这样的失败多是因为胚胎质量问题，那就建议选择泰国三代试管技术进行胚胎质量的筛查，移植优质胚胎，避免多次失败对母体和心理上的伤害。若是母体因素的方面还是要根据个人情况，如果子宫内环境经过调理和治疗仍然不理想，建议考虑代孕完成生殖过程。至于在免疫方面目前生殖医学并没有什么明确的疗效，仍然处于探索中。